UMSIDA melalui LPPM telah membentuk pusat-pusat studi yang berfungsi sebagai wadah pengkajian isu-isu strategis dan problematika yang berkembang di masyarakat maupun dunia ilmu pengetahuan. Pusat studi diarahkan mampu berperan signifikan memberi kontribusi ilmiah maupun praktis bagi perkembangan ilmu pengetahuan dan masyarakat.

Pusat Studi yang ada di UMSIDA meliputi:

  1. Pusat Studi Pangan dan Nutrisi (PSPN)
  2. Pusat Studi Teknik dan Energi (PSTE)
  3. Pusat Studi Ekonomi dan Bisnis (PSEB)
  4. Pusat Studi Kebijakan Publik (PSKP)
  5. Pusat Studi Media dan Komunikasi (PSMK)
  6. Pusat Studi Lingkungan (PSL)
  7. Pusat Studi Pendidikan dan Budaya (PSPB)
  8. Pusat Studi Gender dan Perlindungan Anak (PSGPA)
  9. Pusat Studi Kesehatan dan Psikologi (PSKPi)
  10. Pusat Studi Al-Islam dan Kemuhammadiyahan (PSIK)
  11. Pusat Studi Hukum dan Hak Asasi Manusia (Pusham)